Veeteede Amet loob tingimused ohutu veeliikluse tagamiseks Eesti merealadel ning laevatatavatel siseveekogudel. Amet mõõdistab merd, hoiab korras taristut, koostab navigatsioonikaarte, korraldab laevaliiklust Soome lahel, väljastab meremeestele meresõidutunnistusi, kontrollib laevu ja sadamaid, väljastab merendusega seotud lubasid, juurdleb laevaõnnetusi ja kontrollib väikelaevade ohutusnõuete täitmist.